洁净室在投入运行后，应该满足室内空气洁净度等级的要求以及避免微生物污染或化学污染。应该避免使用过程中的磨损或撞击带来的污染。应该满足耐受洁净室的清洁、消毒需要。应该能承受产品生产或使用过程中的化学品、微生物侵蚀与腐蚀等。因此洁净室的建筑装饰具有与一般建筑装饰不同的、较为严格的要求和特点。
洁净室墙壁的设计与建造均应该满足洁净生产或使用过程中的正常运行，或维护时建筑装饰表面的清洁、消毒要求，并不得引发粗糙或多孔、滞留粒子、化学污染物和繁殖微生物等。所有无尘室的内表面应该做到光滑、无孔、无裂纹、无凹凸不平等。另外，洁净室的四周围护材料要选用气密性良好、在不同温度、湿度下变形小的材料，且不得散发对生产的产品品质有污染物的材料。
近年来，以金属夹芯板（夹芯彩钢板）为墙板的洁净室已经成各种洁净室的主流。夹芯彩钢板的种类较多，洁净室中使用较多的有岩棉夹芯板、无机料夹芯板、石膏夹芯板、纸蜂窝或铝蜂窝夹芯板等。而模块化洁净室中，一般使用框架+钢板、钢化玻璃组合的形式。框架有铝型材、铁方通静电喷涂以及不锈钢材质，钢板有烤漆钢板、不锈钢板，玻璃为双层中空钢化玻璃。
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